Сюжет серіалу «Павуче джерело» розпочинається із загадкового зникнення Насті Урусової, дружини багатого бізнесмена Андрія Лопатіна. Її сестра Кіра, успішна журналістка, вирушає на пошуки Насті на загадковий острів Солона Грива. Місце, оповите міфами про часові аномалії та містичні явища, стає полем для напруженого розслідування.

У перших серіях розкривається складне минуле героїв, зокрема напружені стосунки Кіри та Андрія, які об’єднуються заради спільної мети. Таємничість острова, знахідки, що натякають на брехню місцевих жителів, і несподіваний арешт Андрія створюють гостру драму.

1 серія

Кіра Урусова стала для молодшої сестри Насті не просто старшою сестрою, а справжньою опорою та батьком, давши їй можливість здобути відмінну освіту. Сама Кіра – успішний журналіст, який висвітлює теми подорожей, тоді як Настя прославилася як талановита художниця. Її виставка привернула багато уваги, але різко змінилося, коли Настя вийшла заміж за Андрія Лопатіна, власника великого металургійного концерну. Кіра з самого початку була проти цього шлюбу: Лопатін був старший за Настю на 20 років, і вона вважала, що для нього Настя – лише чергова іграшка. Проте сам Андрій запевняв, що щиро любить її та хоче зробити щасливою.
Кіра хоч і прийняла вибір сестри, але не змогла змиритися з ним, оголосивши чоловікові Насті негласну війну. Через чотири роки шлюбу Кіра засмучена, що сестра повністю закинула свою творчість. Вона часто жартує над зятем, не довіряючи йому, особливо через незрозумілі обставини, пов'язані зі зникненням його першої дружини після розлучення. Андрій завалює Настю подарунками, але сам постійно у роз'їздах, і Кіра впевнена, що сестра нещасна. Настя сподівається, що вагітність змінить їхнє життя, але почувається винною за те, що досі не змогла подарувати чоловікові дитину, тому мандрує святими місцями у пошуках рішення.

2 серія

Подруга показує Кірі фотографію, на якій Андрій вечеряє у ресторані з невідомою жінкою. Впевнена у його невірності, Кіра вирішує все розповісти Насті. Але, зателефонувавши до сестри, вона не може додзвонитися – телефон недоступний. Настя, яка поїхала тиждень тому до чергового святого джерела, вже мала повернутися. Кіра їде до сестри додому, де зустрічає Андрія, який щойно повернувся з відрядження. Він стверджує, що не спілкувався з Настею вже тиждень. Кіра задається питанням, чи справді вони все ще одружені.
Невдовзі з'ясовується, що Настя попрямувала до чудодійного джерела на острові Солона Грива, куди тепер стікаються паломники. Кіра розуміє, що сестра зникла. Вона заявляє Андрію, що займеться пошуками, і якщо з Настею щось трапилося, то він відповість за це. Андрій, який звик до її ворожості, вирішує не залишатися осторонь і теж вирушає на острів.

3 серія

Приїхавши на острів, Кіра та Андрій спочатку уникають один одного, але потім вирішують об'єднати зусилля задля пошуку Насті. Місцеві жителі кажуть, що місце оповите містикою: тут нібито тимчасові аномалії, люди бачать примар, зв'язок не працює, машини виходять з ладу, а люди іноді зникають на роки. Однак ніхто з ключових постатей на острові – ні адміністратор готелю, ні його господиня Магда, ні таксист, ні власник кафе, ні продавець квитків до джерела – не бачив Настю. Все вказує на те, що її тут ніколи не було. Але Кіра має фото сестри у Чаянова джерела, яке вона надіслала перед зникненням, і лялька ручної роботи, подарована їй самій, знайдена в місці паломництва. Це переконує Кіру, що місцеві щось приховують, але навіщо?

4 серія

Намагаючись зрозуміти, що відбувається, Кіра та Андрій зближуються та починають переглядати свої стосунки один до одного. Незабаром на острів приїжджає оперативна група з материка – Андрія заарештовують за підозрою у вбивстві Насті, бо у його гаражі знайшли її закривавлені речі. Кіра відмовляється вірити у винність Андрія, який починає їй подобатися. Але щоб довести його невинність та переконати інших, їй необхідно завершити своє розслідування та знайти сестру.